На главную страницу

Описание пространственной структуры белка PHOQ_ECOLI по данным банка PDB, код 1id0

На рисунке изображена пространственная модель белка, созданная с помощью RasMol. Белок PHOQ показан красным цветом. Ион магния показан зелёным шариком, подписан лиганд ANP молекулы воды, присутствующие в структуре (показаны маленькими голубыми точками).
define cont_B_M 385a, 389a, 390a, 392a, 393a, 415a, 419a, 439a, 434a, 446a
echo The set cont_B_M is defined 
define AA1 385a, 389a, 392a, 393a, 415a, 434a, 439a, 446a
echo The set AA1 is defined
define AA2 390a, 419a
echo The set aa2 is defined                                          
          
Скрипт создан для определения аминокислотных остатков, контактирующих с лигандом; остатки AA1 и AA2, определеные в скрипте используются в описании генно-инженерного эксперимента.

© Низамутдинов Игорь, 2004